Как скрывать алерты, сообщения при показе нового сообщения?

Для этого можно использовать настройку в as.systemOptions.js: 

{
"alert.alwaysHidePrev": true
}

В этом случае при появлении нового alert будут скрываться предыдущие сообщения. 

Также есть и другие настройки alert окна: 

{    
    "alert.alwaysHidePrev": false, // если true, то при появлении нового алерт будут скрываться все предыдущие
    "alert.disableProgress": false,  // скрывать в alert окне progress bar элемент
    "alert.defaultDelay": 7000,   // длительность по умолчанию для alert
    "alert.placement": "center",  // расположение окна алерт (center, leftBottom, leftTop, rightBottom). По умолчанию - справа наверху.
    "alert.defaultDelay": 7000, // задержка окна alert по умолчанию
}